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膜蛋白质组常见问题与解答

  • Q:为什么要研究膜蛋白质组?

    人类蛋白质中有1/3是膜蛋白,很多重要的生物学过程发生在膜上进行。膜蛋白是很多药物的靶点,信号分子的靶点,激酶。目前所注释到的药物靶点中,以膜蛋白作为药物靶点的比例在50%以上,最后应用到药物的研发以及到最后的治疗当中具有很重要的意义。

  • Q:为什么研究膜蛋白质组的时候需要对膜蛋白进行分离,不直接用常规蛋白组的方法检测,生物信息分析的时候对膜蛋白进行分析?

    1)膜蛋白在细胞中虽然种类很多,但是膜蛋白很多都是一些ATP或者GTP偶联蛋白,酶蛋白,通道蛋白等,这一类蛋白功能很重要但是通常情况下丰度并不高,如果不经常富集上质谱,信号很容易被细胞中其他高丰度蛋白掩盖;而通过富集的操作,可以增加组分中膜蛋白的比例,削弱其他蛋白对膜蛋白信号的影响,从而鉴定到更多膜蛋白。

    2)膜蛋白本身大多数是疏水性的蛋白,如果不通过富集,在蛋白提取时得率很低;富集可以提高膜蛋白的得率,从而达到增加鉴定数目的目的。

  • Q:膜蛋白提取方法有哪些?

    1)超速离心,特点处理量大,成分复杂时离心次数多易损失;

    2)密度梯度离心,单次可得到多个组分,样品处理时间长;

    3)试剂盒,操作简单无需特殊设备,不同样本提取有差异;

    4)抗体免疫磁珠,特异性好,纯度高,成本高

    5)生物素,只能分离外膜蛋白,成本高。