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蛋白质很少单独发挥作用,在所有生物功能中,蛋白质复合物的功能占主导地位。在所有细胞中,蛋白质是最重要的组成部分,并且在大多数细胞功能中蛋白质间的相互作用是最基本的活动。研究蛋白质组相互作用的方法主要有酵母双杂交技术(Y2H)、亲和纯化(AP)、化学交联偶联质谱CXMS)等方法。其中AP技术使用特别设计的纯化标签在非常接近于生理条件的情况下,能捕捉出特定的蛋白质及其分子伴侣。
  金开瑞借助高精度质谱平台,开发了一套从实验到生物信息分析的AP-SWATH流程,采用TAP技术将目标靶蛋白的相互作用蛋白特异性富集,然后结合具有高灵敏度、高准确度、高通量等特点的SWATH定量,能够高特异性的准确富集到靶蛋白的特异性相互作用蛋白,实现复合蛋白质的准确鉴定。

技术特点
1、不需要过多的背景知识就可以得到大量含靶蛋白的复合体;
2、通过亲和纯化,得到蛋白质间在生理水平下的真实相互作用数据;
3、结合定量蛋白质组学流程,准确、无偏见地发现蛋白质之间的相互作用。

适用范围
TAP更倾向于高丰度和稳定的相互作用,许多低亲和力、瞬时和依赖特殊细胞环境的相互作用可能检测不到
特别适用于研究蛋白质在生理条件下的相互作用
一次实验只能检测一个蛋白的相互作用蛋白
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