服务介绍
CUT&Tag(Cleavage Under Target & Tagmentation)技术是一种研究蛋白质-DNA互作的新方法,它与ChIP-seq研究目的相同,在建库细胞量、信噪比、样本重复性等都有优势。
CUT&Tag 方法中用到了预装接头 DNA 并与蛋白 A/G 融合的超高活性 Tn5 转座酶。这种融合蛋白能与一抗结合,在抗体附近切割 DNA,并插入带有接头序列的短标签。回收标签化的 DNA 片段后,使用引物识别添加的标签中的序列进行 PCR 扩增,以生成测序文库。
服务流程
客户寄送样本和一抗
样本检测
建库测序
生信分析
客户提供
根据《武汉金开瑞表观项目送样指南》提供实验的样品,并提供IP级别一抗(公司可以提供选购意见)。
样品信息单:需详细填写样品来源、含量、状态及其他基本信息。
最终交付
- <项目报告与数据>
- 测序数据质量评估:过滤掉低质量数据
- 与参考基因组比对:reads分布及比对结果可视化
- peak峰calling:分析蛋白结合位点
- motif分析:蛋白结合序列的偏好性
- peak峰相关基因注释:寻找蛋白潜在调控基因
- 差异peak分析:分析不同样本间差异peak峰
- 相关基因功能分析:相关基因GO、KEGG富集分析