服务介绍
ChIP-seq（Chromatin ImmunoPrecipitation Sequencing）是染色质免疫共沉淀和第二代高通量测序技术的结合，通过组蛋白/转录因子的特异性抗体，将特定的蛋白与DNA复合物沉淀下来。从而获取结合的DNA片段，再通过高通量测序技术，即可获得相应的片段信息。
服务优势
- 项目前后三次质控，保障实验成功率；
- 金开瑞自有抗体生产团队，选择抗体经验丰富；
- 细胞、植物、动物都有大量经验
服务流程
样本准备及交联
DNA片段化及富集
文库质检
测序
生信分析
客户提供
根据《武汉金开瑞表观项目送样指南》提供实验的样品，并提供ChIP级别抗体（公司可以提供选购意见）。
样品信息单：需详细填写样品来源、含量、状态及其他基本信息。
最终交付
- 项目报告与数据：
- 测序数据质量评估：过滤掉低质量数据，保证数据质量
- 与参考基因组比对：reads分布及比对结果可视化
- peak峰calling：分析蛋白结合位点
- motif分析：蛋白结合序列的偏好性
- peak峰相关基因注释：寻找蛋白潜在调控基因
- 差异peak分析：分析不同样本间差异peak峰
- 相关基因功能分析：相关基因GO, KEGG富集分析
