RNA pulldown

RNA pulldown

  • RNA pulldown
  • mRNA组装

服务特色

金开瑞现提供RNA pull down检测技术服务,使用特异性二抗进行检测,能有效避免抗体重链对结果的信号干扰。并且金开瑞配套自己的质谱平台,能显著提升检测效果。

服务介绍

蛋白质与RNA的相互作用是许多细胞功能的核心,如蛋白质合成、mRNA组装、病毒复制、细胞发育调控等。使用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过WB实验检测特定的RNA结合蛋白是否与RNA相互作用。若待检测目的蛋白明确,选择WB鉴定;若不明确,则可选择质谱鉴定。

服务流程

接受订单及样品
RNA探针标记
与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物
与磁珠结合,洗脱
WB检测或者质谱鉴定
结果交付

客户提供

RNA序列或者RNA序列构建的质粒(种属)

相同种属的细胞样品

最终交付

  • 基因合成测序报告;
  • 构建含目的基因的质粒、菌液,测序报告;
  • 体外转录模版的sense&antisense引物、模版电泳图;
  • RNA Pull down蛋白SDS-PAGE银染;
  • 质谱鉴定报告。

服务说明

服务名称 服务内容 交付内容及标准 服务周期(工作日)
RNA pull-down
(体外转录法)
基因合成 测序报告 具体评估
体外转录sense和   antisense模板扩增 体外转录2次 20
sense和antisense体 外转录并标记为探针 探针标记2次(sense、
antisense各1次)
RNA pull-down富集 2次
SDS-PAGE银染 跑胶3个泳道 4
质谱鉴定互作蛋白 质谱鉴定sense、antisense 10-15
RNA pull-down
(探针法拉蛋白)
QPCR检测本
底表达
探针设计及合成  (包 含对照)
样本和内参各1次
circRNA探针-biotin/lncRNA探 针-biotin/普通对照探针
24
RNA探针富集效果 检测 实验探针和对照探针各1次
RNA pull-down富集 实验探针和对照探针各1次
SDS-PAGE银染 跑胶3个泳道 4
质谱鉴定互作蛋白 质谱鉴定对照组和实验组各1次 10-15
RNA pull-down 
  (探针法拉miRNA)
QPCR检测本 样本和内参各1次 28
底表达
探针设计及合成 circRNA探针-biotin/lncRNA探 针-biotin/对照探针
RNA探针富集效果 检测 实验探针和对照探针各1次
RNA pull-down富集 互作的蛋白/miRNA 实验探针和对照探针各1次
RNA和miRNA/lncRNA 逆转录及检测 QPCR检测(input、探针组、 对照组)

案例展示

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