Q：CUT&Tag适用于什么物种? 有什么要求？
适用于常规哺乳动物细胞的蛋白质-DNA互作研究，酵母、植物等细胞可以经过特殊的处理(破除细胞壁或者提取细胞核)来进行实验。分析的时候应该保证该物种有参考基因组，且注释完整，如果需要联合分析，应保证组学基因组和样本命名一致。而细菌样本不适合做CUT&Tag，因为有一层细胞壁，不能直接与Con A beads结合，且细菌没有完整的核结构，因此无法开展此项实验。
Q：CUT&Tag是否可以应用于异染色质上的位点研究或是低丰度的转录因子研究？
CUT&Tag能在异染色质区域检测到组蛋白修饰和结合蛋白，常用于研究异染色质相关的组蛋白修饰，如H3K27me3和H3K9me3。除此之外，它对低丰度转录因子的检测效果优于ChIP-seq，所需细胞量更少，即使这些因子在基因组中的结合位点较少也能精确识别转录因子的结合位点。
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