为什么选择金开瑞的DNA Pull-down技术服务
能够高度特异地富集与目标DNA序列相互作用的蛋白质,具有较低的背景干扰
可对DNA-蛋白质相互作用进行定量分析,测量结合的强度和亲和力
可进行高通量分析,同时研究多个DNA-蛋白质相互作用
仅需要少量的样本即可进行实验,适用于珍贵样本的研究
DNA Pull-down是用于分析蛋白质与DNA互作的一种分析技术,是研究DNA-蛋白质相互作用和调控的有力工具。
该技术首先需要针对待研究目的基因的调控区域设计并制备特异性探针;同时,制备细胞核提取物;将探针和核提取物共同孵育,DNA结合蛋白就会和靶向序列特异性结合;然后,通过亲和素磁珠纯化蛋白质DNA复合物;最后针对获得的蛋白,使用WB验证或者质谱方式鉴定蛋白质类型。
DNA Pull-down技术有助于揭示基因调控网络、信号传导途径和疾病机制等方面的重要信息。
研究转录因子与DNA的结合
揭示基因表达调控机制
分析DNA损伤修复机制
探索染色质结构和功能
标准化流程确保实验结果准确可靠
客户提供DNA序列相关信息或DNA过表达质粒
制备细胞核提取物,进行样品处理
设计并制备特异性探针,进行标记
将探针和核提取物共同孵育,使DNA结合蛋白与靶序列结合
通过亲和素磁珠纯化蛋白质DNA复合物,进行检测或鉴定
提供完整的实验报告和数据
我们接受多种形式的样品,确保实验顺利进行
完整的DNA Pull-down实验报告,包含所有实验步骤和结果分析
实验过程中的质控数据和报告,确保结果可靠
包含定制过程中所有原始数据、图片及质控报告,便于后续研究和发表
详细的服务内容、交付标准和周期说明
金开瑞提供全面的DNA Pull-down技术服务,从样品接收到最终结果交付,全程专业操作,确保实验结果的准确性和可靠性。我们的服务涵盖探针设计、样品处理、实验操作和数据分析等各个环节。
服务名称 | 服务内容 | 交付内容及标准 | 服务周期(工作日) |
---|---|---|---|
DNA pull-down | 探针扩增回收 | 扩增2次 | 16 |
蛋白提取+考染 | 1个样本 | ||
pull down实验 | 富集2次:IgG、IP各1次 | ||
SDS-PAGE银染 | 跑胶3个泳道:IgG、IP、input | 4 | |
质谱鉴定互作蛋白 | 质谱鉴定:IgG、IP | 10-15 |
众多科研机构选择金开瑞的DNA Pull-down技术服务
EMSA是用特定序列的标记探针,同待验证蛋白孵育后进行native-PAGE凝胶电泳,如果存在同探针结合的蛋白,则会出现电泳迁移率明显低于自由探针的条带出现。
DNA Pull-down是将探针结合在凝胶/磁珠上,以此收集同该DNA探针发生互作的蛋白。ChIP实验中所检测的DNA-蛋白互作则发生在活组织细胞内。
问题1:非特异性结合:蛋白质可能与非特定的DNA序列结合,导致背景信号增加。
优化建议:尝试优化DNA探针的设计,选择更特异的DNA序列作为探针,以增加结合的特异性。还可以通过引入竞争性DNA或非特异性DNA序列来减少非特异性结合。
问题2:低信号强度:信号强度较弱,难以检测目标蛋白质的结合。
优化建议:优化孵育条件,包括孵育时间、温度和缓冲液的组成。调整孵育时间可能需要更长的孵育时间,以增加结合的效率。调整温度可以根据蛋白质的最佳结合温度进行优化。此外,优化缓冲液的组成,如添加剂或酶抑制剂,可以提高信号强度。
问题3:浓度依赖性:蛋白质的结合可能与其浓度相关,导致信号的变化不确定。
优化建议:尝试不同浓度的蛋白质进行实验,确定最佳的浓度范围,以获得最强的信号。此外,可以使用标准品或内部对照来定量分析,以校正信号的变化。
问题4:样本纯度不高:样本中可能存在杂质或其他干扰物质,影响目标蛋白质的结合。
优化建议:优化样品处理步骤,如使用高纯度的核酸提取方法,减少杂质的存在。此外,可以使用特异性抗体进行预处理,以去除非特定结合的蛋白质。
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