
虚拟筛选
- 高效稳定
- 专业精准
- 定制化
- 快速交付
服务特色
我们拥有多年虚拟筛选经验,擅长大规模化合物库的批量对接与优先级排序。依托高通量计算集群与AutoDock Vina引擎,精准控制假阳性率,支持靶点定制筛选逻辑,快速交付结合能排名及先导化合物,加速您的药物研发进程。
服务介绍
我们专注于药物研发领域的有机小分子虚拟筛选服务,为科研机构与制药企业提供基于AutoDock Vina引擎的高通量蛋白质-小分子对接分析。本服务主要面向有机小分子配体(符合类药物化学规则的化合物),在此范围内可获得最佳的计算结果与生物学相关性。
服务优势
- 高效稳定:自主研发批量对接脚本,支持同时处理数千个配体分子,大幅缩短计算周期,确保结果准确可靠。
- 信度领先:基于AutoDock Vina引擎,优化对接参数配置,结合能预测精度高,重复性好,满足科研发表要求。
- 数据完整交付:提供结合能排名表、Top化合物对接构象及分析报告,数据完整可追溯。
- 专业团队:核心成员具备多年计算生物学经验,熟悉药物筛选流程,可提供从方案设计到结果解读的全流程支持。
服务流程
客户提供
受体文件(必选)
蛋白质PDB文件(需包含完整氨基酸序列)或UniProt ID/PDB ID 如信息未知需说明物种(如Human/Mouse)
配体文件(必选)
SDF/PDB格式文件,或提供SMILES字符串
对接需求(可选)
明确的结合口袋中心坐标及盒子尺寸或已知活性位点信息
参考抑制剂信息(如有)
计算要求(可选)
对接模式数量(默认9个)
详尽程度(默认8)
服务说明
| 服务名称 |
服务内容 |
交付内容及标准 | 服务周期(工作日) |
| 1.虚拟筛选 |
1.单蛋白 vs 100-1000个配体,虚拟筛选 |
-配体结合能排名表(按亲和力从高到低排序 -排名靠前化合物的详细对接结果(含结合能、相互作用残基) |
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案例展示
常见问题与解析 (Q&A)
支持Windows、Linux和macOS。客户端无需安装软件,仅需提供输入文件即可。
无上限限制。1000个以内推荐标准服务;1000-10000个需评估计算资源;超过10000个建议集群计算。
如客户未提供明确信息,我方可根据文献资料、结构比对或盲对接预测确定最佳对接区域。
AutoDock Vina在标准测试集上结合能预测与实验值的均方根误差约2-3 kcal/mol,排序准确度约70-80%。如需更高精度,建议结合分子动力学模拟。


