酵母双杂交研究蛋白质相互作用的原理
酵母双杂交(Y2H)是常用的蛋白质相互作用研究方法,其原理基于酵母细胞中的转录活性分子的相互作用。
Y2H实验基于以下三个主要组件:
靶蛋白(prey protein):需要研究的蛋白质,它与其他蛋白质进行相互作用。
激活域(activation domain,AD):通常以融合蛋白的形式存在,该融合蛋白同时携带靶蛋白和AD。
DNA结合域(DNA-binding domain,BD):也以融合蛋白的形式存在,它能够结合到启动子区域上,从而促进报告基因的表达。
实验步骤如下:
构建AD和BD融合蛋白质:将靶蛋白与AD载体或BD载体进行融合,得到AD-靶蛋白和BD-靶蛋白两种融合蛋白质。
转化酵母菌:将AD-靶蛋白和BD-靶蛋白构建的质粒分别转化到酵母菌中。
检测蛋白质相互作用:将AD-靶蛋白和BD-靶蛋白转化后的酵母菌培养在选择性培养基上,其中只有当两种融合蛋白发生相互作用时,相应的启动子区域才能被BD结合域激活,从而触发报告基因的表达。
鉴定相互作用:选择性培养基筛选出能够产生报告基因表达的克隆,然后通过进一步验证,如重远程PCR、酵母细胞存活测试等,确认蛋白质之间的相互作用。
Y2H方法的优点包括对于蛋白质与蛋白质之间的直接相互作用的检测、高通量筛选的可行性以及实验操作简单。但也存在一些限制,例如无法模拟细胞内复杂环境下的蛋白质相互作用,以及可能出现假阳性或假阴性结果的问题。因此,在进行Y2H实验时,需要结合其他实验方法和验证手段,综合分析数据,确保结果的可靠性。
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