银染试剂盒适用于哪种凝胶类型?SDS-PAGE凝胶和非变性凝胶的银染操作有区别吗?
银染试剂盒主要适配聚丙烯酰胺凝胶,部分专用款也可用于琼脂糖凝胶,其在SDS-PAGE凝胶和非变性凝胶的银染操作上,因前者含SDS且蛋白呈变性状态,后者蛋白保持天然构象,所以在固定、洗涤等核心步骤存在明显区别,具体如下:
1、适用的凝胶类型
聚丙烯酰胺凝胶:这是银染试剂盒最常用的适配凝胶,像SDS-PAGE凝胶、非变性PAGE凝胶以及双向电泳凝胶均适用。例如Abiowell的蛋白快速银染试剂盒就明确可用于SDS-PAGE或非变性PAGE凝胶的蛋白银染,Dodeca银染试剂盒也能高效检测聚丙烯酰胺凝胶中毫微克级别的蛋白质,该类凝胶分辨率高,能和银染的高灵敏度特点完美匹配。
琼脂糖凝胶:仅少数经化学方法修改的专用银染试剂盒可适配,比如SilverStainPlus试剂盒,其经过优化后能对琼脂糖凝胶中的蛋白质和核酸染色,可检测到低至0.6ng的蛋白质和DNA。不过琼脂糖凝胶分辨率低于聚丙烯酰胺凝胶,所以这种应用场景相对少见,仅用于特定核酸样品的高灵敏度检测。

2、SDS-PAGE凝胶和非变性凝胶的银染操作区别
固定环节:SDS-PAGE凝胶的固定核心是去除凝胶中的SDS,SDS会干扰银离子与蛋白的结合,通常用无水乙醇和冰乙酸混合而成的固定液处理,室温下摇动固定15-20分钟,有时还需重复固定一次,甚至可选择过夜固定,以此充分去除SDS并降低染色背景。而非变性凝胶无需处理SDS,固定的核心目的是固定蛋白的天然构象,防止其在染色过程中扩散,虽固定液配方和前者相近,但无需重复固定,还可适当缩短固定时间,同时会降低乙醇浓度,避免高浓度有机试剂破坏蛋白天然结构,导致条带异常模糊。
洗涤环节:SDS-PAGE凝胶的洗涤步骤要求严苛,在固定后常需用乙醇与水的混合液洗涤两次,再用去离子水清洗,每一步都要保证时长,这样才能彻底清除残留的SDS和固定液里的乙酸等成分,要是洗涤不充分,残留物质会严重干扰后续银染反应,造成背景过深。非变性凝胶的洗涤则相对简单,主要用去离子水进行短时间清洗即可,大多可省略有机相洗涤步骤,只需去除残留的固定液就行,同时要控制好水洗频率和时间,避免过度洗涤破坏蛋白与凝胶的结合状态,导致条带变淡。
显色与后续处理环节:SDS-PAGE凝胶中蛋白已变性,银离子与蛋白的结合位点更稳定,显色时可按常规时间操作,一般3-10分钟,待条带清晰后终止反应即可。而非变性凝胶中蛋白保持天然构象,不同蛋白与银离子的结合能力存在差异,部分蛋白可能结合银离子较弱,显色时可能需要适当缩短时间以防背景过深,也可能需根据条带出现情况及时调整显色液用量;且终止反应后,非变性凝胶需更快用去离子水冲洗并浸泡保存,减少对蛋白天然结构的额外影响,避免条带出现变形、弥散等问题。
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