SWATH定量蛋白质组学

SWATH定量蛋白质组学

服务特色

SWATH(Sequential Window Acquisition of all THeoretical Mass Spectra)是瑞士苏黎世联邦理工学院的Ruedi Aebersold 博士及其团队与AB-SCIEX联合推出的一项全新的质谱技术。

服务介绍

SWATH采集模式将扫描范围划分为以25 Da为间隔的一系列区间,通过超高速扫描来获得扫描范围内全部离子的所有碎片信息,是 MS/MSALL技术的扩展。SWATH技术是一种真正全景式的、高通量的质谱技术,同时也大大提高了定量的可重现性。

客户提供

需鉴定的样品;

样品信息单:需详细填写样品来源、含量、状态及其他基本信息。

最终交付

  • 实验报告一份,含具体实验流程及蛋白质组鉴定及定量结果(生物信息学分析)。
  • 生物信息学分析内容包括:
  • SWATH 参考谱图数据库构建:通过DDA模式的扫描结果,谱图数据库构建、全谱鉴定及结果可靠性评估;
  • SWATH定量:根据二级碎片离子的全扫描结果实现二级离子的定量,SWATH结果可靠性分析,差异表达分析,层次聚类,PCA分析等;
  • 蛋白质功能注释:包括GO注释、COG分类和KEGG Pathway分析;
  • 差异蛋白功能富集:包括GO富集、Pathway富集;
  • 差异蛋白网络互作:基于STRING 数据库的PPI分析,基于Cytoscape的可视化展示。

服务说明

灵敏度高:SWATH技术利用高分辨率的TripleTOF 5600 +系统,达到了与MRM相当的定量灵敏度;

重复性好:重复样品间的定量相关性可达到0.99以上;

定量准确度高:定量准确度几乎与MRM技术相当;

线性动态范围广:定量范围可跨越4个数量级;

通量大:一次实验可检测到2000种以上蛋白并定量。

灵敏度高:SWATH技术利用高分辨率的TripleTOF 5600 +系统,达到了与MRM相当的定量灵敏度;

重复性好:重复样品间的定量相关性可达到0.99以上;

定量准确度高:定量准确度几乎与MRM技术相当;

线性动态范围广:定量范围可跨越4个数量级;

通量大:一次实验可检测到2000种以上蛋白并定量。

自送样起45个工作日

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