SPR技术原理:用光"看"分子握手的全过程

信息来源:金开瑞 作者:genecreate_cn 发布时间:2026-08-12 11:35:54

做药物筛选或者抗体研发的同学应该都听过Biacore,甚至被它折磨过。SPR,全称表面等离子共振(Surface Plasmon Resonance),是一种基于光学的生物分子相互作用检测技术。说白了它干的事情就是:把一个分子固定在芯片上,让另一个分子流过去,然后实时"看"它们怎么结合、怎么解离,整个过程不用任何荧光标记。这个无标记检测是个大优势,因为你不用担心标签影响分子本身的结合行为。Biacore是Cytiva(以前叫GE Healthcare)旗下最知名的SPR仪器系列,在业界基本成了SPR的代名词。今天就把SPR的物理原理、仪器流程、亲和力和动力学分析、芯片选择这几块从头到尾讲清楚。

图:表面等离子共振(SPR)检测原理——光在金膜表面共振耦合实现无标记分子互作检测

 

一、表面等离子共振的物理原理

SPR的核心物理现象,简单说就是金属表面的自由电子在特定条件下跟光发生的共振耦合。要理解这个,你得先知道什么是表面等离子。在金膜或者银膜这种导电材料表面,自由电子不是固定不动的,它们可以在表面平面方向上集体振荡。这种集体振荡的电磁模式就叫表面等离子。

当一束p偏振光(电场矢量在入射面内的偏振光)以大于全反射临界角的角度照射到玻璃-金属膜界面时,会发生全反射。但在全反射的瞬间,光并不是完全被弹回去,而是有一小部分电磁场穿透到金属膜的另一侧,形成所谓"倏逝波"——这个波的振幅随距离指数衰减,穿透深度大概100-200纳米。当倏逝波的频率和波矢正好跟表面等离子匹配的时候,光能量就被耦合进表面等离子里去了,反射光的强度会在特定角度出现一个明显的下降,形成一个"共振谷"。这个角度就叫共振角或者SPR角。

关键来了:共振角的位置对金属表面附近的折射率变化极其敏感。如果金膜表面结合了生物分子(比如蛋白、DNA),这些分子的折射率跟水不同,表面附近的折射率就会变化,共振角就会偏移。分子结合得越多,折射率变化越大,共振角偏移越多。SPR仪器测的就是这个偏移量,以RU(Response Unit)为单位,1 RU大约对应金膜表面1 pg/mm2的质量变化。整个检测过程不需要标记任何荧光分子,因为分子本身的折射率差异就足以产生信号。这种基于Kretschmann棱镜构型的设计,是几乎所有商业SPR仪器的光学基础。虽然听上去全是物理的东西,但实际操作中你不需要去管共振角在哪,仪器会自动追踪并转化成RU信号输出,你看到的就是一条随时间变化的结合曲线。

二、Biacore仪器与检测流程

Biacore系列仪器是SPR领域的标杆产品,常见的型号有Biacore X-100、Biacore T200、Biacore 8K和较新的Biacore 1系列。不管哪个型号,核心架构都差不多:光学检测系统、微流控系统、温控系统和芯片接口。光学系统负责产生和检测SPR信号,微流控系统负责把样品精准输送到芯片表面,温控系统控制反应温度,一般在4-45度可调,常规实验放在25度,芯片表面反应温控范围通常标称15-30度。

一次典型的Biacore实验流程大概是这样的。第一步是配体偶联:把你感兴趣的分子(配体)固定到芯片表面。最常用的是氨基偶联法,用EDC/NHS活化芯片表面的羧基,然后配体的氨基跟活化后的羧基形成共价键,最后用乙醇胺封闭未反应的活化位点。偶联量一般在几百到几千RU,具体取决于分子量和实验目的。第二步是分析物注射:把不同浓度的待测分子配成一系列浓度梯度,依次流过芯片表面。每个浓度的注射过程包含结合相(association phase,分析物跟配体结合,信号上升)和解离相(dissociation phase,换成缓冲液冲洗,分析物从配体上脱落,信号下降)。第三步是再生:用一段酸或者碱短时间冲洗芯片,把残余的结合物洗掉,让芯片表面恢复到基线状态,为下一个浓度做准备。整个一个循环下来大概1-5分钟,一整套浓度梯度做完可能半小时到两小时。

数据处理上,Biacore会同时记录一个参比通道(reference cell)的信号,这个通道没有固定配体或者固定了不相关的蛋白,用来扣除缓冲液流过时的背景信号和非特异性吸附。最终的传感图(sensorgram)是样品通道减去参比通道的差值信号。Biacore 8K这类高端型号有8个流通池,可以同时跑8组检测,通量大幅提升。微流控系统的精度也决定了数据质量——现在的仪器能控制流速在1-100 uL/min范围,样品消耗低至几个微升,对珍贵的蛋白样品很友好。

三、亲和力常数的测定方法

亲和力常数,具体说就是平衡解离常数KD(equilibrium dissociation constant),是衡量两个分子之间结合紧密程度的核心参数。KD值越小,结合越紧。比如一个抗体的KD在纳摩尔级(10^-9 M)就算不错的亲和力了,皮摩尔级(10^-12 M)那是非常高的亲和力。SPR测KD有两条路径:稳态亲和分析和动力学拟合。

稳态亲和分析的逻辑比较直观。你注射一系列不同浓度的分析物,每个浓度注射足够长时间让结合达到平衡——也就是说结合速率和解离速率相等了,信号不再上升,稳定在一个平台值Req。然后以Req对分析物浓度C作图,拟合Langmuir结合等温线方程:Req = Rmax x C / (KD + C)。拟合出来的KD就是平衡解离常数。这种方法的好处是不依赖动力学模型假设,只要你能确认确实达到平衡了就行。但问题在于,对于高亲和力的分子(KD很小),达到平衡可能需要非常长的时间,几分钟甚至几小时,实际操作中往往等不起。

所以这时候就得靠动力学路径了。动力学拟合是同时拟合结合相和解离相的整条传感曲线,通过1:1 Langmuir模型提取结合速率常数ka和解离速率常数kd,然后KD = kd / ka。这条路径不需要等到达平衡,从曲线的上升和下降趋势就能算出KD,适用范围更广。两种方法各有优劣,实际做实验时通常两种都用,互相验证。如果稳态KD和动力学KD对得上,说明数据质量可靠;如果差很多,那可能是模型不合适、存在非特异性结合或者传质限制。另外要注意的是,KD只是热力学参数,告诉你"最终结合多紧",但不告诉你"结合多快、解离多快",后者就得看动力学分析了。

四、动力学速率分析的解读

动力学速率分析是SPR相比其他亲和力检测方法(比如ELISA、ITC)的独特优势,因为它能实时拆解出ka和kd这两个速率常数。ka是结合速率常数(association rate constant,单位M-1 s-1),也叫on-rate,反映的是两个分子相遇后形成复合物的效率。kd是解离速率常数(dissociation rate constant,单位s-1),也叫off-rate,反映的是复合物分开的快慢。

解读这两个参数你得分开看。ka主要受分子扩散速率和碰撞后有效取向概率的影响。典型的蛋白-蛋白相互作用ka在10^4到10^6 M-1 s-1之间。如果ka偏低,可能意味着分子在溶液中的有效碰撞率低,或者结合需要特定的构象变化。kd则反映复合物的稳定性。比如一个小分子药物跟靶蛋白的kd如果是10^-3 s-1,意味着大约每700秒有一半的药物分子从靶点上掉下来;如果kd是10^-5 s-1,那就是将近一天才掉一半——药效持续时间完全不同。所以药物研发中kd是个特别受关注的指标,你希望药物在靶点上待得久,off-rate越慢越好。

拟合动力学数据最常用的模型是1:1 Langmuir结合模型,假设一个配体分子结合一个分析物分子,没有cooperativity。但实际情况往往没那么理想。如果你看到传感图在结合相明显弯曲(不是指数上升),解离相也不干净,可能存在几个问题。第一个是传质限制(mass transport limitation):分析物在溶液中扩散到芯片表面的速度跟不上结合消耗的速度,导致表面浓度低于体相浓度,这时候ka会被低估。解决办法是降低配体偶联量、提高流速。第二个是异质性或者多价结合,这时候可能需要用bivalent analyte模型或者conformational change模型来拟合。总之,动力学拟合不是软件一键出结果就完事的,你得理解模型假设,看残差图判断拟合质量。好的拟合残差应该随机分布在零线附近,不应该有系统性偏移。

五、生物传感芯片的类型与选择

芯片是SPR实验的核心耗材,选对芯片实验就成功了一半。Cytiva的Sensor Chip系列是使用最广泛的,型号从CM5到SA、NTA、L1、C1、CM3、CM7,搞得新人一脸懵。其实分类逻辑很清晰:芯片表面覆盖了一层不同的化学层,决定了你怎么固定配体。

CM5是当之无愧的万金油芯片,表面是羧甲基葡聚糖(CM-dextran)水凝胶层,通过EDC/NHS氨基偶联固定蛋白。葡聚糖层是三维的,表面积大、偶联容量高,适合大多数蛋白-蛋白和蛋白-小分子相互作用。CM3的葡聚糖链更短,偶联容量低一些,好处是传质限制小,适合动力学精确测量。CM7是高偶联容量的版本,适合小分子分析(小分子分子量小,信号弱,需要更多配体来放大信号)。

SA芯片表面预包被了链霉亲和素,专门用来固定生物素化的配体。生物素-链霉亲和素结合力极强(KD约10^-15 M),固定后基本不会脱落,再生条件可以很剧烈。NTA芯片通过组氨酸标签螯合镍离子来固定His-tag蛋白,好处是固定方向可控、可再生、条件温和,特别适合膜蛋白这种脆弱样品。L1芯片表面是亲脂性的,可以捕获脂质体和细胞膜囊泡,用来做膜蛋白在天然膜环境下的相互作用研究。C1芯片表面是平坦的羧基层,没有葡聚糖,偶联容量低但非特异性吸附也少,适合分析带正电荷的分子。

芯片选择的基本原则是:蛋白配体首选CM5走氨基偶联,做不成功再考虑SA或NTA替代方案;小分子分析物的话配体固定量要大,选CM7或高偶联的CM5;膜蛋白考虑L1芯片配脂质体;如果配体很难共价偶联又没有可用的标签,可以试试捕获法——先固定一个捕获分子(比如抗Flag抗体),再捕获带Flag标签的配体,这样配体方向均一而且可再生。芯片的价格不便宜,一片CM5要一千多块钱,所以实验前一定想清楚用什么芯片、怎么固定、偶联多少量,别上来就浪费。

SPR技术发展到今天,已经成为分子相互作用分析的金标准之一。它的核心价值在于实时、无标记、能量化——你不仅知道两个分子结不结合,还知道结合多紧、结合多快、解离多慢,这些信息在药物研发和基础研究中都是不可替代的。当然SPR也有局限,比如对样品纯度要求高、通量不如ELISA、膜蛋白不好搞。但只要你理解了原理、选对了芯片和模型,拿到高质量的数据并不难。这门技术的门槛不在操作,而在数据解读——能把传感图读出故事来,才算真正掌握了SPR。




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