看文章和做实验怎么选择
信息来源:金开瑞 作者:genecreate 发布时间:2017-12-13 17:05:10
我们在设计课题、写标书的时候,常常遇到这样的问题:找到了一个新的分子,这个分子是在疾病组(或者实验组)高表达,而且通过细胞和动物实验证明了它的功能,在做机制的时候常遇到的问题是:为什么这个分子是高(低)表达的?也就是该分子表达异常的上游机制。
关于这一点,我们在前面以lncRNA为例介绍了很多机制,总体来说可以分为转录水平、转录后水平,甚至是蛋白翻译水平(这一点包括在转录后水平),这是整个框架,大家在考虑的时候一定要有这种整体概念,不要被局部的研究主题(比如microRNA)所限制,否则一旦一个主题做不出来,就很容易遇到困境,本来科研就有风险,一条路走不通我们可以考虑其他的路,不要在一棵树上吊死,条条大路通课题嘛!
展开来说,组蛋白修饰、转录因子、DNA的甲基化修饰、基因的拷贝数变异等等,这些都是影响分子表达的转录水平的因素;可变剪接、RNA降解(比如microRNA介导)、RNA翻译等等这些是在转录后发生的RNA水平的影响分子表达的因素;当蛋白被翻译出来以后,蛋白会被修饰(比如磷酸化)从而影响活性,被折叠(如果折叠异常,蛋白不能形成正常的构象,也会影响到功能),当然,按照我们前面对分子机制的归类,活性和表达分属不同机制,还有就是蛋白的降解,比如我们以前说过的蛋白的泛素化途径降解;
因此,理论上说,当我们在研究蛋白异常表达的机制时,我们需要考虑这么多因素,比如我们首先需要对这么多因素进行检测,比如在10个可能性里面有三个可能性(比如蛋白的低表达可能同时由于基因被转录因子抑制、microRNA抑制mRNA翻译和蛋白被泛素化降解所导致的),那么我们选择一个方向或者几个方向做就可以了,当然,如果我们可以多做几个,研究发表的文章分数会更高,比如我们介绍过的一篇nature((文章篇)S5E23: 研究microRNA发Nature的策略及延伸),对microRNA分子let7的异常低表达就是做出了三个因素;对课题申请来说,一个面上项目要求的复杂性也可以通过这种多因素来解决。
当然,除了上游的分子机制外,下游的机制也可以同样这么来思考,换个位置而已。
说了这么些,主要想说的意思是,大家在做课题的时候一定要有这种理论支撑,尽量能从全局的角度来考虑课题。做实验很重要,看文章也同样重要,文章看好了真的是能少走很多弯路,也经常有新的思路出来。
最新动态
-
05.14
四大研究利器(Co-IP、BIFC、Y2H、GST pull-down)助力速配蛋白互作“最佳拍档”
-
05.14
高效、精准、直观、实时——取经“蛋白互作研究翘楚”BIFC!
-
05.14
转染效率低、干扰效果差、重复性欠佳...siRNA研究频遇“拦路虎”怎么办?
-
04.22
一文读懂EMSA技术核心要点,让“emsa” 秒变“easy”
-
04.02
4·2世界孤独症日 | 聆听“星”声“泌”语,让爱来,让碍走
-
04.01
酵母杂交核心技术:深度Q&A帮你轻松突破实验瓶颈
-
03.19
【客户文献解读,IF>11】食管癌的"隐形推手":MALR-ILF3-HIF1a轴的强大作用
-
03.18
siRNA介绍及药物研发的现状前景
-
03.18
知无不“研”|5篇高分文献带你一览高通量酵母杂交的非凡魅力~
-
02.27
【客户文章分享】SHMT2 通过 5′UTR 依赖性 ADAM10 翻译启动介导小分子诱导的阿尔茨海默病病理学缓解过程