细胞运动性检测实战指南:划痕实验与Transwell迁移侵袭全流程解析

师兄师姐踩坑笔记 · 新手避雷必读 细胞生物学 | 实验技术实战:细胞运动性检测实战指南,划痕实验与Transwell迁移侵袭全流程解析。
做肿瘤转移研究的同学,细胞迁移侵袭实验那是跑不掉的基本功。今天咱们就把最常用的两套方案——划痕实验和Transwell,从头到尾捋一遍。这篇文章不讲那些花里胡哨的理论,就讲实操,讲踩坑,讲怎么把数据做漂亮。新来的师弟师妹们搬好小板凳,咱们开讲。
划痕实验,也叫wound healing assay,是最经典的体外检测细胞迁移能力的方法。操作简单、成本低,但坑也不少,下面一步步来。
1、细胞划痕实验原理
说白了就是在细胞上划一刀。先把细胞养到长满培养皿底,形成一层融合的单层细胞(confluent monolayer),然后用枪头在中间人为制造一个空白区——也就是"伤口"。接下来把细胞放回培养箱,观察边缘的细胞会不会往中间这片空地爬。细胞划痕实验原理的本质,就是模拟体外的伤口愈合过程:细胞失去了接触抑制,开始向空白区域迁移,一段时间后伤口逐渐被"填上"。我们通过测量伤口面积随时间的变化,就能量化细胞的迁移能力。
这个实验看着简单,但原理上有两个关键点你得搞明白。第一,划痕实验测的是"集体迁移"(collective migration),是整片细胞一起往里挪,不是单个细胞乱跑,所以它更接近伤口愈合、上皮修复这类生理过程。第二,细胞"填满"伤口其实有两股力量在起作用:一是真的迁移过去的,二是细胞自己分裂增殖"撑"过来的。这俩搅在一起,你的数据就不纯了。所以后面我们会专门讲怎么把增殖这个干扰因素摁住。

图1. 细胞划痕实验示意图:在融合单层细胞上制造伤口,观察细胞向中央迁移愈合的过程
2、伤口愈合率计算
做完了实验,数据怎么算?这里有个标准公式,必须记牢:伤口愈合率计算的公式是 愈合率(%) = (A₀ − Aₜ) / A₀ × 100%。其中 A₀ 是0小时的初始伤口面积,Aₜ 是t时刻的伤口面积。举个例子,0小时你量出来伤口是50000平方微米,24小时后变成20000平方微米,那愈合率就是 (50000 − 20000) / 50000 × 100% = 60%。这个数字越大,说明细胞爬得越快、迁移能力越强。
踩过坑的都知道,算这个愈合率最容易出问题的是面积测量的准确性。同一个伤口,你框得松一点紧一点,面积能差出好几千。所以一定要固定好测量方法,0小时和各时间点用同一套标准来框。另外别忘了设对照组——比如正常细胞和敲低某个基因的细胞一起做,对比愈合率才有意义。还有一点,愈合率不是越高越好,如果24小时伤口几乎全愈合了,说明细胞爬太快,你中间的时间点可能就漏掉了关键变化,下次可以把时间点加密,或者换迁移慢一点的细胞系。
3、ImageJ面积分析
面积怎么量?手动数格子肯定不行,这时候就轮到ImageJ上场了。ImageJ面积分析是划痕实验数据处理的标配操作。具体步骤是这样的:打开ImageJ,把照片拖进去,用多边形工具(Polygon Selection)沿着伤口边缘一圈一圈地把伤口区域圈出来——注意要沿着细胞前沿走,圈得太靠里太靠外都不准。圈好之后,点菜单栏 Analyze → Measure,弹出来的窗口里有个"Area"值,这就是伤口面积,单位是像素或者你标尺校准后的实际面积(平方微米)。
这里有几个细节别嫌麻烦一定要做。第一,先用标尺照片校准ImageJ的scale,不然你量出来的是像素不是真实面积,没法比较不同实验批次。Set Scale这一步千万别跳过。第二,圈伤口的时候建议把图片放大,用放大镜工具看得清边缘,手抖的话可以多圈几次取个平均。第三,如果伤口边缘不整齐、形状复杂,多边形工具比矩形准多了,别图省事用矩形框。第四,同一批照片建议用同一套阈值和分析参数,保证可比性。ImageJ虽然界面土了点,但它是免费的、功能强大的,熟练了比什么商业软件都顺手。
注意事项:ImageJ校准标尺一定每个物镜倍数单独做一套,4倍、10倍、20倍的像素/微米换算系数不一样,混用就全乱套了。拍照的时候记得拍一张带标尺的照片用来校准。
4、低血清培养基抑制增殖
前面原理部分说过,细胞"填"伤口有迁移和增殖两股力量。怎么把增殖摁住?最常规的做法就是换低血清培养基。低血清培养基抑制增殖的原理很简单:血清里有大量生长因子,刺激细胞分裂增殖,把血清浓度降下来,细胞基本就不怎么分裂了,那剩下的伤口愈合就主要靠迁移。
具体怎么操作?正常培养用10% FBS的培养基,做划痕实验的时候换成0.5%到2% FBS的低血清培养基。我个人经验,2%是比较稳妥的浓度——既能保住细胞活性不让它们饿死,又能把增殖压到很低。如果做到0.5%,有些娇气的细胞系(比如某些原代细胞)可能扛不住,24小时就状态不行了。换低血清的时机也有讲究:一般是划痕完了、PBS洗掉脱落的细胞之后,立刻换成低血清培养基,然后才开始拍0小时的照片。这样从一开始增殖就被摁住了。
不过说实话,低血清只能减少增殖,没法100%消除。血清里哪怕只剩0.5%,还是有一点点生长因子。如果你的实验对增殖干扰特别敏感,光靠低血清不够,那就得上下面这个大招了。
5、丝裂霉素C预处理
想要彻底排除增殖干扰,丝裂霉素C了解一下。丝裂霉素C预处理是划痕实验里专门用来"冻结"细胞增殖的杀手锏。丝裂霉素C是一种DNA交联剂,能跟DNA形成共价键,让DNA没法复制,细胞就卡在细胞周期里动不了——分裂这条路彻底堵死。这样你测到的伤口愈合,就是纯纯的迁移,一点增殖的水分都没有。
具体用法:在划痕之前,用含丝裂霉素C的培养基处理细胞1小时左右,浓度一般用10 μg/mL(不同细胞系可能有差异,建议查文献或预实验摸一下)。处理完之后吸掉药液,用PBS洗两三遍,洗掉残留的丝裂霉素C,再正常做划痕。这样处理过的细胞,增殖基本被按了暂停键,接下来24到48小时内的伤口变化,就是迁移说了算。
踩坑提醒:丝裂霉素C是有毒的化疗药,操作一定戴手套在通风橱里配,别直接接触。另外浓度别太高、时间别太长,不然细胞不光不增殖,连命都没了,迁移也别想了。预实验一定要做,找到"增殖被抑制但细胞还活着且能爬"的甜蜜点。
6、划痕宽度控制
划痕这道"刀"怎么下,直接决定实验成败。划痕宽度控制是划痕实验里最考验手感的一环。标准做法是用10μL的枪头(或者200μL枪头,看你想要多宽),贴着培养板底,垂直、匀速地划一条直线。正常情况下宽度大约500到800微米,这个范围比较合适——太窄了细胞两小时就爬满了没意义,太宽了细胞爬半天都愈合不了,时间拉太长增殖干扰又回来了。
划的时候几个要点:第一,枪头要垂直拿,别斜着,斜着划出来的伤口一边宽一边窄,没法准确测量面积。第二,力度要均匀,轻轻贴着底划过去就行,别使蛮劲——用力过猛会把整片细胞都刮下来,伤口边缘参差不齐,那就毁了。第三,划痕尽量走直线,手要稳,新手可以拿直尺比着练几次找感觉。第四,划完之后一定用PBS轻轻洗两遍,把刮下来的游离细胞冲掉,不然这些碎细胞会重新贴回去,把伤口"假愈合"了。洗的时候动作轻一点,别把边缘的细胞也冲掉了。
还有个小技巧:划痕的时候可以多划几条平行的,形成网格状,这样每个孔里有多个伤口可以取平均值,数据更稳。但别划太密,伤口之间得留够细胞生长的空间,不然互相干扰。
7、固定视野拍照
最后一个关键步骤,也是最容易翻车的地方——拍照。固定视野拍照的核心要求是:0小时、6小时、12小时、24小时……每个时间点都要在同一个位置拍,曝光参数还得一致。不然你0小时拍的是伤口这头,24小时拍的是那头,面积怎么比?曝光不一样,ImageJ识别边缘的阈值也得跟着变,又乱套了。
怎么保证同一个位置?老办法是在培养板底下做个十字标记(用记号笔画),拍照时把十字对准视野某个固定位置,下次拍的时候再对准这个十字,位置就找回来了。现在有些高级显微镜有坐标记忆功能,存个坐标下次自动回去拍,那就更省事。不管用什么方法,总之你得能找回同一个点。
曝光参数这块,第一张照片(0小时)定好亮度、对比度、曝光时间之后,后面所有时间点都用同一套参数,别去调。如果0小时太暗想调亮,那也只在0小时调,调完记下来数值,后面照搬。拍照时物镜倍数也要固定,4倍或10倍比较常用——倍数太高视野太小看不到完整伤口,倍数太低伤口边缘看不清没法量面积。建议每个时间点、每个伤口多拍几张不同位置的,最后取平均,数据更靠谱。还有,细胞从培养箱拿出来拍照要快,拍完赶紧放回去,别让细胞在室温待太久影响状态。
划痕实验搞定了,咱们进阶到Transwell。这套实验比划痕复杂得多,但能模拟更接近体内的迁移和侵袭场景,是肿瘤转移研究的核心手段。
8、Transwell迁移实验原理
Transwell这套装置的核心是一层半透膜,把培养空间分成上下两个小室。Transwell迁移实验原理说白了就是:利用上下室不同的培养条件制造一个"诱惑",让上室的细胞穿过膜跑到下室去。具体怎么诱惑?上室放无血清培养基(细胞饿着),下室放含血清或者趋化因子的培养基(有吃的),细胞感受到下面有好东西,就会从膜上面钻过去。一段时间后,数一数有多少细胞穿过来了,就知道迁移能力有多强。
跟划痕实验比,Transwell有几个优势。第一,它检测的是"趋化迁移"(chemotaxis),细胞是奔着浓度梯度主动跑的,更接近体内细胞跟着信号分子走的真实场景。第二,膜把上下隔开,穿过来的细胞是"真·迁移"的,不像划痕还有增殖干扰。第三,通过调整下室的趋化因子种类和浓度,你可以精确研究特定分子对迁移的影响,灵活性很高。当然代价就是操作复杂、变量多、容易翻车,下面咱们一个环节一个环节说。

图2. Transwell小室结构示意图:半透膜分隔上下两室,细胞从上室穿过膜迁移至下室
9、Transwell侵袭实验
迁移实验会了,侵袭实验就是在它基础上加一层"路障"。Transwell侵袭实验和迁移实验的区别就在于:迁移实验的膜是"裸"的,细胞直接穿过去就行;侵袭实验在膜上面铺了一层Matrigel基质胶,细胞得先降解、突破这层基质,才能穿到下面去。这层Matrigel模拟的是体内的细胞外基质(ECM)和基底膜,所以侵袭实验检测的是细胞"突破屏障"的能力,更贴近肿瘤细胞在体内侵袭转移的真实过程。
为什么要分迁移和侵袭两套?因为这两个能力不是一回事。有些细胞迁移能力强(能跑),但侵袭能力弱(不会"拆墙");反过来也有。肿瘤转移是个复杂过程,细胞既要会跑又要会拆,所以研究肿瘤恶性程度的时候,迁移和侵袭往往要一起做、对比着看。如果你的细胞穿迁移膜没问题但穿不过Matrigel,说明它运动能力够但降解基质的能力不行;如果两个都穿不过去,那基本可以判断这细胞运动能力本身就弱。

图3. 细胞侵袭基质胶过程:细胞分泌基质金属蛋白酶降解Matrigel,穿透基质胶与半透膜到达下室
10、基质胶(Matrigel)铺胶
侵袭实验最关键、最容易翻车的环节就是铺胶。基质胶(Matrigel)铺胶这步做好了,实验成功一半;做砸了,后面全白搭。Matrigel是从小鼠肉瘤里提取的基底膜基质,里面含有层粘连蛋白、IV型胶原这些ECM成分。它有个要命的特性——室温以上会很快凝固,所以全程都得在冰上操作。
铺胶流程是这样的:先把Matrigel从−20度或−80度拿出来,放到4度冰箱过夜缓慢解冻(千万别拿手里搓或者放室温化,一化就凝了)。解冻后用预冷的无血清培养基稀释,稀释比例一般1:6到1:10,浓度越高"墙"越厚越难过。稀释用的枪头、离心管全都要预冷,放冰上。取适量稀释好的Matrigel(一般上室加50到100微升),用预冷枪头沿着上室侧壁缓慢加入,别直接往中间倒,容易产生气泡。加完轻轻晃匀,让胶均匀铺满膜。然后放到37度培养箱孵育1小时左右,让Matrigel凝固成胶冻状。
致命提醒:基质胶一裂你就等着重新来吧!凝固过程中千万别晃动小室,晃了胶面不平甚至裂开,侵袭结果全废。孵育结束后轻轻吸掉没凝固的液体(有的方案会保留),然后用无血清培养基轻轻洗一次。整个铺胶过程建议在冰盒上操作,动作要快但手要稳。
11、趋化因子梯度
细胞凭什么要从上室往下面钻?因为有趋化因子梯度在"勾引"它。趋化因子梯度是Transwell实验的驱动力,说白了就是下室的"诱饵"比上室香,细胞闻着味儿就往下游跑。最常用的诱饵就是血清——下室加含10% FBS的完全培养基,上室是无血清的,血清里的生长因子和趋化因子形成浓度差,细胞就追着这个梯度迁移。
如果想研究特定趋化因子的作用,可以在10% FBS的基础上叠加特异性的趋化因子,比如SDF-1(CXCL12)就是常用的,它对表达CXCR4的细胞有很强的趋化作用。加多少、怎么加,得查文献摸浓度,一般纳克到微克每毫升这个量级。设置梯度的时候要注意:下室的体积要足够(一般500到800微升),液面要能接触到上室膜的底部,不然细胞穿过去之后掉到下室液体里数不到;但也不能太多把上室顶起来。上下室的液面差和浓度差一起构成了趋化动力,浓度差越大迁移越强,但太大了可能反而饱和,所以梯度也要预实验优化。
12、细胞饥饿处理
细胞种进Transwell之前,先得饿它一顿。细胞饥饿处理的目的有两个:一是清除细胞内残留的血清信号,让细胞对趋化因子更敏感、反应更强烈;二是让细胞周期同步化到G0/G1期,减少增殖对迁移的干扰。具体做法是:接种到Transwell之前,把细胞换到无血清培养基里养6到12小时(有的做24小时,看细胞耐受性)。
饥饿时间要把握好。太短了血清没清干净,细胞对下室的趋化因子反应迟钝,迁移数偏低;太长了细胞饿出问题,活力下降甚至凋亡,那迁移也别想了。一般6到12小时是个比较安全的窗口,大部分肿瘤细胞系都能扛住。饥饿完了之后收集细胞、计数,用无血清培养基重悬到合适浓度,再种到上室。重悬的时候吹打要轻柔均匀,保证单细胞悬液,别一团一团地种上去。接种密度也得控制好,太少了穿过去的细胞数不够统计,太多了细胞挤在一起影响迁移——一般24孔板的上室种2万到10万个细胞,具体根据细胞大小和迁移能力调整。
13、8μm孔径膜选择
Transwell膜的孔径不是随便选的,选错了细胞根本穿不过去。8μm孔径膜选择是针对贴壁肿瘤细胞的通用标准——像HeLa(宫颈癌)、MDA-MB-231(乳腺癌)这些常见的贴壁肿瘤细胞系,8μm的孔径刚好够它们挤过去但又不会太容易,能拉开不同迁移能力细胞之间的差距。
但不同细胞大小不一样,孔径也得跟着变。巨噬细胞个头大,8μm挤着费劲,得用12μm的膜;白细胞(比如淋巴细胞)个头小又灵活,8μm太宽松了没区分度,要用3到5μm的膜。选膜的总体原则是:孔径比细胞直径略小一点,细胞得"使劲"变形才能钻过去,这样测出来的才是主动迁移能力,而不是被动漏下去的。如果你不确定该用多大孔径,先查你用的细胞系的文献,看别人用的什么规格,照着来最稳妥。另外买Transwell的时候注意看产品说明,同一个小室规格可能有多种孔径可选,别买错了。
14、结晶紫染色计数
细胞迁移/侵袭结束了,怎么数穿过来的细胞?最经典的方法就是结晶紫染色。结晶紫染色计数的流程是:先把Transwell小室取出来,吸掉培养基,用PBS洗一下,然后放4%多聚甲醛里固定20分钟(室温)。固定完PBS再洗一遍,接着放到0.1%结晶紫染液里染色15到20分钟,染完用自来水或PBS轻轻冲洗掉多余的染料——冲洗的时候水流别对着膜冲,容易把细胞冲掉。染好之后,膜的下面(下室那面)会附着紫色的穿膜细胞,上室那面如果处理得当应该是干净的。
计数怎么数?可以用显微镜拍照后用ImageJ的Cell Counter插件手动点数——插件菜单Plugins → Analyze → Cell Counter,一个个点过去,适合细胞数不多的情况。如果细胞数多,也可以用ImageJ先转灰度、设阈值、用Analyze Particles自动计数,但自动计数对染色背景要求高,背景不均匀容易误判。不管手动还是自动,建议每个膜随机选5个以上视野拍照计数取平均,乘以整个膜的面积换算成总细胞数,这样数据更有代表性。拍照时记得低倍镜(4倍或10倍)先全貌、高倍镜(20倍)再细节。

图4. 结晶紫染色结果:穿膜细胞被染成紫色,通过计数可量化细胞迁移与侵袭能力
15、棉签擦拭上室
最后这个步骤看着不起眼,但做不好前面全白干。棉签擦拭上室是染色计数前的一道"清场"工序。为什么要擦?因为种在上室的细胞,大部分并没有穿膜,它们还贴在上室那面的膜上。如果不把这些"没本事穿过去"的细胞擦掉,染色的时候它们也会被染成紫色,到时候你分不清哪些是穿过去的、哪些是赖在上面的,计数就全乱套了。
具体操作:固定之后(注意是固定之后,固定之前擦会把要数的穿膜细胞也带掉),用湿润的棉签轻轻擦拭上室那面的膜。棉签要先蘸湿PBS或水,挤掉多余水分保持微湿就行。擦拭的力度——这个真得靠手感,棉签轻微弯曲那个力度差不多,轻轻转着擦两三圈。力度太轻擦不干净,上室残留细胞干扰计数;力度太重就麻烦了,棉签擦太使劲把膜都擦破了那就真的芭比Q了,膜一破这个样本直接报废,没救。新手建议先拿废弃的Transwell练几遍找手感,别拿正式样本上手。擦完之后可以低倍镜快速看一下上室面是否干净,确认没问题再进行染色。这一步做好了,你最后拍到的紫色细胞才是真·穿膜的,数据才经得起检验。
师兄的最后嘱咐:Transwell实验变量多,每一步都可能翻车。建议正式实验前先做一次预实验,把铺胶、接种密度、迁移时间这些参数摸清楚。迁移时间一般12到24小时,侵袭因为要过基质胶会更久,可能24到48小时。宁可多做几个时间点也别只做一个,数据点越多趋势越清楚。还有,每组至少做3个复孔,这是底线。
划痕和Transwell这两套实验,一个是简单直接的伤口愈合模型,一个是精密复杂的趋化迁移侵袭模型,各有各的用武之地。做肿瘤转移、伤口修复、药物筛选的同学,这两个实验基本是标配。新手刚上手肯定会翻几次车——划痕划歪了、Matrigel凝坏了、膜擦破了——这些都是学费,别气馁。多练几次手感就来了,等你做到闭着眼睛都能铺出平整的基质胶、棉签一擦力度刚刚好的时候,你也就成了师弟师妹们眼里的"实验大神"了。实验这事儿,没别的捷径,就是多练、多想、多总结。祝大家实验顺利,数据漂亮,Paper多发!
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