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分子互作研究

Q：ATAC-seq与ChIP-seq等其他表观遗传方法相比如何？

ATAC-seq能够捕获所有的开放染色质区域，而不仅仅是那些与特定因子结合的区域，它能够寻找样本内的表观遗传变化。对于具有已知序列结合基序的蛋白质，可以逐个细胞地识别在开放染色质中富集到哪些基序。

Q：ATAC-seq可以使用冷冻样本吗？

冷冻细胞：需解冻后立即裂解，分离细胞核（冻存可能导致核膜损伤，需优化裂解时间）。组织样本：需机械/酶解离后过滤去除碎片，通过蔗糖梯度离心纯化细胞核。

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