磷酸化蛋白质组学常见问题解答
信息来源:金开瑞 作者:genecreate 发布时间:2018-10-25 14:25:42
1. 蛋白质磷酸化发挥作用的途径:(信号传导)
2. 真核细胞蛋白质磷酸化位点一般位于(丝氨酸)、(苏氨酸)、(赖氨酸)
3. 蛋白激酶在细胞信号转导途径主要作用:(调节细胞活性)、(放大传导信号)
4. 目前常用的磷酸肽富集方式(TiO2)、(IMAC)
5. 磷酸化蛋白组定性分析包括(单一磷酸化位点鉴定)、(全谱鉴定)
6. 磷酸化蛋白组定量分析包括(iTRAQ)、(label free)、(SWATH)
7. 磷酸化蛋白质组学一般要求蛋白起始量达到(3mg)
8. 我公司使用的磷酸化富集方法是(Fe-IMAC)
9. 磷酸化鉴定数目多少的最大影响因素是(样品本身的磷酸化水平)
10. 磷酸化蛋白质组学信息分析包括经典分析和高级分析,请问分别是哪些?
(1)经典分析包括:修饰蛋白、修饰位点鉴定;鉴定结果特征分布:肽段长度、蛋白覆盖度分布、unique肽段分布;修饰位点motif预测;蛋白质GO功能分类、COG注释、Pathway通路注释;
(2)高级分析包括:蛋白质网络互作预测;蛋白质Domain预测;磷酸化蛋白激酶预测。
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